Почти в пять раз — с 124,2 до 567,9 тыс. тонн — на ОНПЗ выросло производство судового маловязкого топлива. С января по июнь 2012 года на Омском НПЗ было выпущено 785,7 тыс. тонн авиационного топлива и 920,5 тыс. тонн тяжелого топлива для судовых установок, что на 10,4% и 44,9% превышает показатели аналогичного периода прошлого года.
В мае 2012 года на Омском НПЗ состоялся пуск в промышленную эксплуатацию первой очереди комплекса гидроочисток моторных топлив — установки гидроочистки бензина каталитического крекинга мощностью 1,2 млн тонн. Вторая установка комплекса — гидроочистки дизельного топлива мощностью 3 млн тонн — будет введена в эксплуатацию в 3 квартале 2012 года. Пуск этой мощности, одной из крупнейших в России, позволил значительно увеличить выпуск на ОНПЗ бензинов и дизельных топлив, соответствующих 4 и 5 экологическим классам. Планируется, что с 2013 года все высокооктановые бензины производства Омского НПЗ будут соответствовать 5 экологическому классу Технического регламента по качеству моторных топлив.